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Éditeurs
Langues
Editions Matériologiques
-
La diffusion de la Covid-19 ; que peuvent les modèles ?
Juliette Rouchier, Victorien Barbet
- Editions Matériologiques
- 6 Octobre 2020
- 9782373612578
Face à l'irruption de la Covid-19, ont surgi des demandes urgentes de prédire, d'expliquer et de faire comprendre sa diffusion aussi bien géographique que sociale, notamment lorsqu'il s'agissait de soutenir telle ou telle décision politique ou de santé publique (distanciations, confinement, etc.). Plusieurs modèles computationnels - en particulier à agents - ont été bien vite mis en avant. Mais dans quelle mesure sont-ils réellement à même de remplir de telles fonctions, en particulier dans un contexte aussi contraint et variable?? Ce livre propose un ensemble d'analyses précieuses et salutaires pour qui voudra former son jugement à ce sujet. Il s'appuie sur des exemples et des analyses de plusieurs modèles de diffusion de la Covid-19, dont certains ont été utilisés par les pouvoirs publics. Il propose aussi des modèles alternatifs, dont certains inédits. Il s'adresse à un large lectorat. Les analyses techniques y sont effectuées avec beaucoup de pédagogie, sans sacrifier à la précision. Elles peuvent donc intéresser les concepteurs et utilisateurs de modèles, les étudiants, les élus, les associations concernées et tout citoyen soucieux de comprendre ces outils omniprésents. Au-delà du cas de la Covid-19, on y trouve une mise en perspective et une discussion plus générale concernant l'usage des modèles formels en sciences sociales, en particulier dans le cadre de l'aide à la décision publique. Analysant le contexte de la crise que l'on traverse, les auteurs évitent de donner un point de vue personnel, mais au contraire tentent d'aider chacun à avancer dans sa propre réflexion, en mettant en avant les questionnements qui peuvent s'adosser aux modèles présentés.
L'ouvrage comprend deux parties?: l'une qui propose une analyse critique de modèles existants, l'autre prenant la forme de trois propositions de modèles qui permettent de percevoir la richesse et la multiplicité des modèles agents de diffusion de maladie - à la fois dans leur conception et leur manipulation. Un glossaire et un intermède sur les «?apports des modèles agents en général et pour la Covid-19 en particulier?» replacent ces réflexions dans le cadre plus large de la simulation agents appliquée aux sciences sociales. -
Qu'est-ce que la science... pour vous ? 50 scientifiques et philosophes répondent
Marc Silberstein, Collectif
- Editions Matériologiques
- 15 Mars 2017
- 9782373611083
Table des matières
Marc Silberstein
Introduction. Vous avez dit « science(s) » ? (page 3)
Jean Audouze
La science, ses progrès et ses piétinements (page 11)
Arnaud Banos
Ma progressive découverte de la science (page 17)
Adrien Barton
L'ontologie est-elle une science ? (page 21)
édouard Brézin
Qu'est-ce que la science pour moi (page 27)
Gérald Bronner
Désincarcérer la rationalité (page 33)
Mario Bunge
Sciences et philosophie, un dialogue (page 39)
Fabrice Cahen
L'« instinct scientifique » de Martin Eden (page 43)
Gilles Campagnolo
La science est un opéra total - un opéra du réel (page 51)
Denis Caroti
Comment ai-je (enfin) compris ce qu'était la science... (page 57)
Pascal Charbonnat
La science, outil d'incorporation au monde (page 63)
Stéphane Colombi
La science pour moi, sa mise en oeuvre et son expression (page 67)
Antoine Danchin
Produit de l'écriture, la science fait l'humanité de l'homme (page 71)
Christophe Darmangeat
Le cardeur scientifique (page 77)
Pierre Deleporte
Rencontres avec la philosophie des sciences (page 81)
Pascal Engel
Réalisme scientifique sans complexes (page 87)
Michael Esfeld
La science comme libération (page 93)
Charles Galperin
La science comme vocation (page 97)
Nicolas Gauvrit
L'esprit critique formalisé (page 101)
Jean Gayon
Qu'est-ce qu'un scientifique ? De la splendeur du vrai au métier (page 107)
Jean Génermont
Où se niche la science ? Regard d'un biologiste (page 113)
Yves Gingras
Qu'est-ce qu'une science ? (page 119)
Gabriel Gohau
Les deux sciences... de la Terre (page 125)
Philippe Grandcolas
La science et notre relation avec le monde :
l'équilibre entre sclérose et incertitude (page 129)
Jean Iliopoulos
Science, connaissances, sagesse (page 133)
Laurent Jodoin
Comment définir la science ? (page 139)
Gérard Lambert
Méthode, utopie et culture (page 145)
Maël Lemoine
Jouer le jeu de la science (page 151)
Françoise Longy
La pluralité des sciences et l'idéal de la science (page 157)
Pascal Ludwig
Un marché libre des idées (page 163)
François Maurice
Une triade scientifique ? (page 169)
Michel Morange
Une quête humaine toujours inassouvie (page 175)
Maël Montévil & Matteo Mossio
Une brève discussion sur la science, autour d'un verre (page 179)
Françoise Parot
Le chemin vers le doute (page 185)
Michel Paty
La science comme pensée et comme expérience objective du monde (page 191)
Alain Pavé
Point de vue d'un modélisateur (page 199)
David Piotrowski & Yves-Marie Visetti
Comment et à quoi pensent les disciplines linguistiques ? (page 205)
Dominique Raynaud
Inférer l'inconnu à partir du connu (page 215)
René Rezsohazy
Faire acte de création (page 221)
Armand de Ricqlès
La science : une méthode offrant des réponses
adéquates aux questions posées par la réalité (page 227)
Dominique Rojat
Rêves de science (page 233)
Angélique Stéphanou
La science, quête et conquêtes (page 239)
Hervé This
Mehr Licht ! (page 243)
Véronique Thomas-Vaslin
Questionnements et connaissance de la complexité (page 251)
Claudine Tiercelin
La science, la métaphysique et l'esprit scientifique (page 257)
Franck Varenne
Une recherche de représentations recroisant ses sources (page 263)
Denis Vernant
De la science aux sciences (page 267)
Pierre Wagner
Sur ce que nous voudrons que la science soit (page 273)
Bernard Walliser
Les deux piliers de la science (page 279)
-
La reconstruction phylogénétique ; concepts et méthodes
Pierre Darlu, Pascal Tassy, Cyrille d' Haese, Rene Zaragüeta i bagils
- Editions Matériologiques
- 14 Janvier 2019
- 9782373611731
Les arbres évolutifs, ou phylogénies, racontent une histoire, l'histoire des êtres vivants, de leur morphologie et de leurs gènes, mais aussi, l'histoire des langues, des textes, des faits culturels ou même des idées. Ces arbres sont avant tout des hypothèses sur les liens de parentés qui exigent réflexions à la fois sur les faits et sur les méthodes. Ce livre définit les concepts fondamentaux de la reconstruction phylogénétique. Il explique la nature et la diversité des approches pratiquées depuis leurs balbutiements au XIXe siècle jusqu'à nos jours. Il insiste, de manière pédagogique et aussi objectivement que possible, sur leurs performances et leurs limites, en fonction de la nature des données étudiées.
Cet ouvrage constitue une version largement augmentée de La Reconstruction phylogénétique. Concepts et méthodes publié en 1993 dans la collection « Biologique théorique » des éditions Masson. Il tient donc compte des méthodes et débats qui ont marqué l'évolution rapide de la discipline ces vingt-cinq dernières années.
Il s'adresse aux étudiants des 1er, 2e et 3e cycles et aux chercheurs non spécialistes de phylogénie mais désireux de connaître l'état actuel de la question.
-
Ce que peuvent les sciences ; une enquête
Vincent Jullien
- Editions Matériologiques
- 1 Juin 2020
- 9782373612424
Théories, expériences, modélisations et controverses sont constitutives du développement des sciences de la nature, telles que la physique, la chimie, la biologie, ou la géologie. Cet ouvrage de philosophie défend le point de vue selon lequel l'étude de l'histoire des sciences est nécessaire pour les comprendre et pour reconnaître que les théories scientifiques sont à la fois toujours plus puissantes, mais aussi presque toutes éphémères. L'auteur soutient que des connaissances scientifiques nombreuses et de grande portée résultent de tels allers-retours, ce qui justifie pleinement la thèse du progrès scientifique.
Une partie du livre est consacrée aux relations existantes entre les sciences de la nature et les mathématiques - celles-ci sont d'une autre essence que les premières?: leurs objets sont immatériels et intemporels. Pour cette raison, l'étroite association entre la physique et les mathématiques, mais aussi désormais entre la biologie et les mathématiques ne peut pas annihiler la distinction de nature entre elles. Le monde des mathématiques et celui des sciences naturelles demeurent à jamais distincts.
Une idée centrale ici défendue est la suivante?: s'il y a bien progrès des connaissances scientifiques, il y a aussi et surtout accroissement de ce que les humains ignorent au sujet de la nature, de l'Univers et de la vie. Chaque découverte apporte plus de questions nouvelles que de réponses. En revanche l'intensité de notre dialogue avec la nature s'accroît spectaculairement grâce à l'activité scientifique.
L'auteur présente enfin des arguments pour soutenir que les sciences et les techniques sont deux réalités et deux genres d'activités fondamentalement distinctes?; Albert Einstein n'est pas plus responsable de la bombe à hydrogène, que Galilée de l'artillerie, ou Darwin de l'eugénisme. -
L'émergence de la médecine scientifique
Anne Fagot-largeault
- Editions Matériologiques
- 1 Janvier 2012
- 9782919694068
Table des matières
Introduction
Partie I
Chapitre 1 / Ulrich Trölher: Surmonter l’ignorance thérapeutique : Un voyage à travers trois siècles
Chapitre 2 / Hee-Jin Han: Pierre-Jean-Georges Cabanis et l’exigence de l’empirisme en médecine
Chapitre 3 / Alfredo Morabia: La convergence historique de l’épidémiologie et de la médecine clinique, de Pierre Louis à l’AMBRE
Partie II
Chapitre 4 / Alain Leplège: Mathématisation de l’incertitude en médecine. Aspects épistémologiques et méta-éthique
Chapitre 5 / Jean-Paul Amann: La philosophie de l’essai clinique selon Austin Bradford Hill
Chapitre 6 / Zbigniew Szawarski: Le concept de placebo
Chapitre 7 / Claude Debru: La classification des leucémies lymphoïdes chroniques : évolution et problèmes d’une approche scientifique
Partie III
Chapitre 8 / Iain Chalmers , Larry V. Hedges & Harris Cooper: Une brève histoire des synthèses de la recherche
Chapitre 9 / Jeanne Daly: Chercheurs d’or : médecine « evidence based » et science de la clinique
Partie IV
Chapitre 10 / Élodie Giroux: Les modèles de risque en médecine : quelles conséquences pour la définition des normes et pour le jugement clinique ? Exemple du calcul du risque cardiovasculaire
Chapitre 11 / Pierre Corvol: La génétique de l’hypertension artérielle et ses limites
Chapitre 12 / Olivier Steichen: La médecine factuelle et les rapports de cas
Chapitre 13 / Christian Brun-Buisson: Playdoyer pou l’EBM, ou comment nier les évidences.
Les contributeurs
Index des noms
-
Le vivant discret et continu ; modes de représentation en biologie théorique
Nicolas Glade, Angelique Stephanou
- Editions Matériologiques
- 1 Septembre 2013
- 9782919694235
Extrait
Introduction
Nicolas Glade & Angélique Stéphanou
Le vivant discret et continu : dualité et complémentarité des modes de représentation en biologie théorique
Chapitre 1
Jacques Demongeot
Des biomathématiques pour modéliser le vivant
1] Introduction : panorama général des biomathématiques
2] Des biomathématiques discrètes pour modéliser le vivant
3] Des biomathématiques continues pour modéliser le vivant
4] Perspectives
5] Conclusion
Chapitre 2
Samuel Bernard
Modélisation multi-échelles en biologie
1] Introduction
2] Du monoéchelle au multi-échelles en biologie
3] Modèles basés sur les équations maîtresses
4] Modélisation individu-centré
5] Modèles hybrides continus-discrets
6] Modèles EDP structurés
7] Conclusion et discussion
Chapitre 3
Vitaly Volpert, Nikolay Bessonov, Nathalie Eymard, Alen Tosenberger
Modèle multi-échelle de la dynamique cellulaire
1] Introduction
2] Régulation intracellulaire et extracellulaire
3] Mouvement du milieu
4] Modèle multi-échelle
5] Applications
6] Discussion
Chapitre 4
Arnaud Chauvière, Haralampos Hatzikirou, Marco Tektonidis & Andreas Deutsch
Introduction aux automates cellulaires de type « latticegas ». Application à la croissance in vitro des gliomes et à l’identification de leurs mécanismes d’invasion
1] Introduction et objectifs du cours
2] Généralités sur les automates cellulaires de type « lattice-gas »
3] Modélisation de la croissance in vitro des gliomes
Chapitre 5
Emmanuel Promayon
Modéliser les cellules comme des objets déformables 3D couplant biomécanique et chimie
1] Introduction
2] Modélisation
3] Simulations
4] Conclusion
Chapitre 6
Pascal Ballet, Alain Pothet, Gradimir Misevic, Anne Jeannin-Girardon, Alexandra Fronville, Vincent Rodin
Une approche multi-agent pour la simulation en biologie cellulaire
1] Introduction
2] Historique
3] Le défit de l’interdisciplinarité
4] Modèle informatique
5] Exemples d’application
6] Enseignement et simulation individu-centré
7] Conclusion
Chapitre 7
Julien Berro
Approches individus-centrées pour l’étude du cytosquelette
1] Introduction
2] Le cytosquelette est un auto-assemblage de biopolymères
3] Dynamique des filaments isolés
4] Organisation collective de filaments et production de forces
5] Organisation de structures intracellulaires
6] Conclusion
Chapitre 8
Stéphanie Portet
Assemblage in vitro des filaments intermédiaires
1] Introduction
2] Méthode
3] Résultats
4] Conclusion
5] Annexe : Dérivations des ki,j
Chapitre 9
Hugues Berry
Modélisation de la diffusion-réaction dans les milieux intracellulaires encombrés
1] Le mouvement passif des macromolécules dans la cellule
2] Modéliser la sous-diffusion anormale
3] Conclusion : Sous-diffusion discrète, continue voire hybride
Chapitre 10
Patrick Amar
Étude comparée de quelques méthodes de simulation de réactions biochimiques
1] Modélisation continue à équations différentielles
2] Modélisation discrète
3] Le simulateur HSIM
4] Oscillations et horloges biologiques
Chapitre 11
S. Randall Thomas
Modélisation en physiologie
1] Introduction
2] Principes de base de biophysique et de thermodynamique
3] Régulation à long terme de la pression artérielle : modèles physiologiques multi-organe, multi-échelle
4] Fonction rénale et homéostasie
5] Annexe
Chapitre 12
Pierre Baconnier
Fractales, chaos et complexité en physiologie. À propos de la physiologie de la respiration chez les mammifères
Préambule
1] Introduction
2] Morphologie de l’arbre trachéo-bronchique et géométrie fractale
3] Oscillateurs respiratoires et chaos
4] Systèmes complexes et physiologie
Conclusion
Chapitre 13
Éric Fanchon
La vie, les machines, l’information et les systèmes dynamiques
1] Introduction : The language of God et The Book of Life…
2] Gènes, séquences, information génétique
3] Concept d’information, théorie de l’information
4] Schrödinger : stochasticité et ordre biologique
5] Notion de programme et déterminisme génétique
6] Complexité et mesures de complexité
7] Le vivant et la machine
8] La fonction biologique
9] Modéliser la dynamique des systèmes vivants
Chapitre 14
Sylvain Lespinats
Le fléau de la dimension en biologie théorique
1] Les métriques
2] Dimension de l’espace et dimension intrinsèque des données
3] Le fléau de la dimension
4] Réduction de la dimension et analyse visuelle des données
Auteurs & résumés/abstracts -
La culture scientifique et technique à 24 images/seconde
Robert Nardone
- Editions Matériologiques
- 1 Février 2012
- 9782919694105
Table des matières
Préface de Girolamo Ramunni
Introduction. La culture scientifique et technique et le cinéma : une longue histoire
Chapitre 1. Définitions : culture, sciences, techniques, cinéma
Chapitre 2. La culture scientifique et technique ou composantes scientifiques et techniques de la culture
Chapitre 3. La vulgarisation scientifique
Chapitre 4. Un problème de représentation
Chapitre 5. Les différents vecteurs de diffusion des composantes scientifiques et techniques
Chapitre 6. Le cinéma comme vecteur de diffusion dominant
Chapitre 7. Institution télévisuelle et institution scientifique, une lutte de pouvoir symbolique
Chapitre 8. Les web TV destinées à l’information scientifique et technique, un domaine encore inexploré
Chapitre 9. Cinéma à composantes scientifiques et propagande
Conclusion. L’image d’une calebasse n’a pas le goût de la bière de mil
-
Biological Warfare : Another French Connection, is the first book to summarize the history of France's biological warfare programs. Highlighting the complex and always secret conceptual genesis of the notion of biological warfare in France, Etienne Aucouturier shows that the contemporary institutional separation between chemical and biological weapons converges in reality on the same project, that of providing armies with the capability to selectively target living organisms or physiology by means of surgical strikes that use poisons or pathogens.
From the invention of microbial aerosols before the First World War, to the last chemical weapons tests in the Algerian desert in the 1970s, the book documents the scientific and technical research conducted to achieve this military capability. It reports on the constant interaction between the military and civil biomedical research spheres in France during the 20th century, while at the same time retracing the history of the debates between politicians, soldiers and scientists on the subject of biological warfare, and reveals how this important aspect of the military strategy of the last three French Republics was discussed at the highest levels of state, scientific and military hierarchies. Drawing on a large number of archival documents that have subsequently become difficult to consult, Aucouturier demonstrates the way in which these secret interactions gave rise to a sort of covert agreement between France's biomedical institutions and its military strategists.
By reversing the order of current analysis - which dissociates, in principle, chemical and biological weapons - and focusing on the military's goal of selectively targeting the living, the book also provides a dynamic and historically justified conceptual framework that permits the reader to consider, and to fear, the possible future forms that biological warfare may take. -
La guerre biologique ; aventures françaises
Etienne Aucouturier
- Editions Matériologiques
- 15 Juin 2017
- 9782373611267
Table des matières
Remerciements et dédicaces (page 3)
Liste des sigles (page 5)
Préface de Jeanne Guillemin (page 7)
Avant-propos (page 17)
Introduction. La guerre biologique : aventures françaises (page 23)
1] Définitions
2] Plan du livre
3] Éléments contextuels et contraintes méthodologiques
Chapitre 1. Guerre microbienne, guerre bactériologique (page 37)
1] Quelques formes élémentaires d'épidémies provoquées
2] Guerre microbienne et guerre bactériologique
3] La Première Guerre mondiale fut-elle aussi « bactériologique » ?
Chapitre 2. Premières aventures françaises (page 55)
Chapitre 3. La création d'un programme français d'armement biologique (1921-1940) (page 65)
1] La poudrerie du Bouchet
2] La menace allemande
Chapitre 4. Le sort du programme français pendant la Seconde Guerre mondiale (page 81)
1] Le SIPN et l'Omnium des produits azotiques
2] La débâcle et la Station d'essai du Bouchet
3] La guerre biologique : en un (nouveau) sens populationnel
Chapitre 5. La Libération et la Commission médicale de défense contre la guerre moderne (page 93)
Chapitre 6. Le savoir-faire allemand et « l'odieuse contrainte » (page 107)
1] Le point de vue de la victime et « l'odieuse contrainte » de penser en agresseur
2] Aérosols et nuages : « Faire la pluie et le beau temps »
3] Un vaccin contre la radioactivité ?
Chapitre 7. Vers une défense biochimique (page 121)
1] La fin (provisoire) de la guerre « bactériologique »
2] Le Commandement des armes spéciales (CAS)
Chapitre 8. La Commission des études et expériences chimiques et bactériologiques (page 135)
1] Destruction massive et dommages aux écosystèmes
2] Statistiques et populations
Chapitre 9. Destruction massive et réaction en chaîne (page 147)
1] Provoquer des résultats bien définis dans l'espace et dans le temps
2] Des armes de pourrissement
3] Les vecteurs mécaniques : fusées et obus
Chapitre 10. Vers un réarmement : 1959-1965 (page 163)
1] Un rapprochement avec les États-Unis et les Pays-Bas
2] Une relance lente
3] Privilégier les incapacitants ?
Chapitre 11. Réorganisations et privatisations (page 179)
1] Un recours massif à la sphère privée
2] Petits et gros animaux
Chapitre 12. Les essais du Sahara et la Sodeteg (page 191)
1] Aromates, épices et B2-Namous
2] Les moutons de la Sodeteg
3] Lampadaire et Marjolaine
Chapitre 13. Le secret d'État et la loi (page 207)
1] Le rôle de la Sodeteg
2] Qu'en fut-il de la guerre biologique en France après 1972 ?
3] Composer avec la loi : offense et prophylaxie
4] Le troublant destin de la Sodeteg
Conclusion (page 229)
Index (page 231)
-
La lutte des parties dans l'organisme
Wilhelm Roux
- Editions Matériologiques
- 1 Mai 2012
- 9782373610949
Table des matières
Avant-propos des éditeurs (2012)
Avant-propos des traducteurs (2012)
Préface de Thomas Heams (2012)
Avant-propos de Wilhem Roux
Chapitre I. L'adaptation fonctionnelle
1] Les performances
2] Hérédité des effets de l'adaptation fonctionnelle
[2.1] Observations
[2.2] éléments théoriques sur l'hérédité et le développement
Chapitre II. La lutte des parties dans l'organisme
1] Fondement
2] Types et performances de la lutte des parties
[2.1] La lutte des molécules
[2.2] La lutte des cellules
[2.3] La lutte des tissus
[2.4] La lutte des organes
3] Résumé des performances de la lutte des parties
Chapitre III. Mise en évidence de l'effet trophique des stimuli fonctionnels
Résumé
Chapitre IV. Effets différenciateurs et formateurs des stimuli fonctionnels
Chapitre V. De l'essence de l'organique
Chapitre VI. Résumé
-
Le zéro et le un ; histoire de la notion d'information au XX siècle
Jérôme Segal
- Editions Matériologiques
- 29 Mars 2018
- 9782919694051
Etude approfondie de la notion scientifique d'information.
La notion d'information est particulièrement polymorphe, luxuriante même. Ses définitions prolifèrent, son domaine lexical est si vaste que la probabilité que deux spécialistes de l'information (sans plus de précision) évoquant cette notion ne parlent en fait pas de la même chose est très élevée. Nous avons tous une idée vague et courante de que ce terme veut dire, nous utilisons tous ce vocable aux multiples acceptions propres à notre quotidien, tandis que les physiciens et les mathématiciens, entre tentatives de formalisation rigoureuses et multiplications des domaines d'application de l'information, développent sans cesse leur compréhension de ce que certains voient comme une nouvelle catégorie du réel. Les sciences humaines, via notamment les sciences de l'information et de la communication, et la linguistique, ont également contribué à l'inflation conceptuelle et lexicale des usages et significations de ce terme. Quant à la biologie, il est patent qu'elle a incorporé l'information à son socle théorique de manière massive. Cette discipline est sans doute celle où cette notion est des plus discutées, notamment parce que la biologie peut dialoguer avec la physique, l'informatique et les mathématiques via la notion d'information, et parce que le programme génétique, Deus ex machina du fonctionnement cellulaire pendant ces cinquante dernières années, est redevable de fortes critiques issues de théories très stimulantes. Le chapitre 7, véritable essai de 110 pages sur « ?l'information et le vivant? : aléas de la métaphore informationnelle? », offre une vision panoramique de cette histoire dense et complexe.
Le livre de Jérôme Segal permet de comprendre les racines historiques et épistémologiques de cette profusion et des confusions qui continuent encore trop souvent à perturber notre perception de la notion scientifique d'information. Il s'interroge également sur l'unité du savoir que certains théoriciens de l'information ont cru fonder sur cette instance du réel qui a véritablement révolutionné le XXe siècle et qui sera sans nul doute un objet scientifique crucial durant le siècle en cours.
A travers cet ouvrage, découvrez les racines historiques et épistémologiques de la profusion et des confusions qui sont aujourd'hui caractéristiques de la notion d'information.
EXTRAIT
Qu'il s'agisse des écrits de Turing, Gabor, MacKay, Shannon ou Wiener, il est possible de considérer que c'est bien la même notion d'information qui apparaît même si les définitions et cadres d'applications varient sensiblement. L'information est dans tous les cas une grandeur mathématiquement définie dont l'utilisation se distingue aisément de l'emploi courant du mot « information ».
À PROPOS DE L'AUTEUR
Jérôme Segal est maître de conférences en histoire à l'université Paris IV (ESPE Paris). Il est également chercheur associé à l'UMR SIRICE (Sorbonne-Identités, relations internationales et civilisations de l'Europe) à Paris ainsi qu'à l'Institut Ludwig Boltzmann d'histoire sociale à Vienne. -
Les mondes darwiniens Tome 1 ; l'évolution de l'évolution
Marc Silberstein
- Editions Matériologiques
- 29 Mars 2018
- 9782919694044
Une étude approfondie des théories darwiniennes et de leurs différentes implications
La théorie darwinienne de l'évolution reste le paradigme dominant de la biologie et de la paléontologie. Elle prouve sa fécondité et sa puissance explicative dans de très nombreux domaines. Pourtant, dans cet ouvrage, pas question d'un fétichisme de Darwin, mais d'un examen attentif du domaine de validité épistémologique et expérimental des idées du savant naturaliste. Ainsi, ce livre expose leurs multiples ramifications en sciences de la vie, en sciences humaines et en philosophie. A cette fin, cinquante auteurs explorent les grandes notions qui irriguent les sciences de l'évolution, ainsi que de très nombreux chantiers des savoirs biologiques contemporains, puis considèrent les tentatives d'exportation du mode de pensée darwinien à propos de problématiques autrefois hors de son champ d'action (éthique, psychologie, économie, etc.). Les questions du créationnisme et de l'enseignement viennent clore cet ouvrage.
Le premier volet d'un ouvrage collectif et enrichissant, qui explore la pensée de Darwin et l'examine sous toutes ses coutures.
EXTRAIT
Dans le paradigme darwinien qui nous préoccupe ici, l'enjeu est donc de reformuler la question « qu'est-ce qui varie ? » en « quelles sont les variations qui peuvent se transmettre par le jeu des pressions évolutives ? ». C'est une restriction drastique de la précédente mais on va le voir, elle demeure incroyablement vaste.
À PROPOS DES AUTEURS
Les mondes darwiniens est le résultat de la collaboration de cinquante auteurs, sous la direction de Thomas Heams, Philippe Huneman, Guillaume Lecointre et Marc Silberstein. -
Analyse des réseaux sociaux appliquée à l'éthologie et l'écologie
Cédric Sueur, Collectif
- Editions Matériologiques
- 1 Avril 2015
- 9782919694976
[Table des matières]
Avant-propos (page 5)
Cédric Sueur
Introduction (page 7)
Cédric Sueur
Chapitre 1 (page 21)
Cédric Sueur, Sebastian Sosa & Nicolas Perony
De l'utilité de l'analyse des réseaux sociaux
dans l'étude du comportement animal
1] Définition d'un réseau social
2] Propriétés globales d'un réseau social
3] Caractéristiques intrinsèques aux données issues
du comportement animal et méthodes analytiques
4] Logiciels utilisés en analyses des réseaux sociaux
5] Mesurer les attributs et rôles des individus
6] Entre l'individu et le groupe :
mesures intermédiaires ou de communauté
7] Propriétés de la structure sociale à l'échelle du groupe
8] Comparer les réseaux
9] Conclusion
Chapitre 2 (page 49)
François Massol, Franck Jabot,
Stéphanie Manel, François Munoz
étude des réseaux en écologie
1] Définitions, concepts et historique
1.1] Métapopulations et concepts associés
1.2] Ecologie du paysage
1.3] Les réseaux d'interaction
1.4] Propriétés topologiques des réseaux
2] Pourquoi s'intéresser aux réseaux en écologie ?
2.1] Origine et maintien de la diversité biologique
2.2] Dynamiques des systèmes écologiques
2.3] Complexité des réseaux d'interaction
2.4] Fonctionnement des écosystèmes
2.5] Distribution géographique des espèces
3] Les réseaux de contact
3.1] Réseaux de contact en épidémiologie
3.2] Dynamique de la biodiversité sur un réseau de contact
3.2.1] Connectivité de populations et
de communautés dans un paysage hétérogène
3.2.2] Dynamique de réseaux de populations et de communautés
4] Les réseaux trophiques et autres réseaux multipartites
4.1] Modélisation des réseaux trophiques et des réseaux d'interaction
4.2] Méthodes empiriques pour l'étude des réseaux trophiques
4.3] Utilisation des réseaux bipartites et multipartites en écologie spatiale
Chapitre 3 (page 99)
Yann Tremblay, Camille Assali,
Andréa Thiebault, Raphaël Jeanson
Utilisation des nouvelles technologies
dans la mesure des réseaux sociaux
1] Enregistrer les positions d'une multitude d'individus
1.1] Vidéo 3D
1.2] Radar
2] Enregistrer les interactions entre individus
2.1] Enregistreurs de proximité
2.2] Puces RFID
2.3] Caméras embarquées
2.4] Enregistreurs de plongée
3] Manipuler les interactions entre individus
3.1] Robots
3.2] Chirurgie/lésion
4] Les méthodes d'analyses
Chapitre 4 (page 119)
Raphaël Jeanson, Daniel Charbonneau,
Alessandro Cini, Cristian Pasquaretta
Réseaux d'interactions chez les insectes
1] Méthodologie
2] Réseaux sociaux chez les fourmis
3] Réseaux chez les guêpes
4] Réseaux sociaux chez la drosophile
5] Réseaux épidémiologiques
6] Conclusion
Chapitre 5 (page 137)
Johann Mourier & Serge Planes
Réseaux sociaux chez les poissons
1] Méthodologie
1.1] Techniques de marquage et identification des individus
1.2] Acquisition des données
2] Intérêt des réseaux sociaux dans l'étude des poissons
2.1] Structure de population et organisation sociale
2.2] Familiarité et fidélité à un site
2.3] Coopération et décisions collectives
3] Directions futures
3.1] Étendre l'utilisation des réseaux sociaux
à une plus grande diversité taxonomique
3.2] Structure génétique et rôle de l'apparentement
dans les réseaux sociaux chez les poissons
3.3] Utiliser la théorie des réseaux sociaux pour
comprendre les mécanismes des agrégations à grande échelle
Chapitre 6 (page 161)
Palmyre Boucherie, Mylène Mariette, Margaux Rat,
Philipp Heeb, Claire Doutrelant, Christophe Bousquet
Application de l'analyse des
réseaux sociaux chez les oiseaux
1] Couples et jeunes : caractérisation de
l'organisation sociale de l'espèce
1.1] Soins parentaux et reproduction communautaire
1.2] Apport des réseaux sociaux
pour l'étude du choix du partenaire : où et comment ?
1.3] Copulations hors couple et séparations :
ce que les réseaux sociaux pourraient nous apprendre
2] Relations hors couple :
stratégies individuelles au sein des systèmes sociaux
2.1] Relations sociales hors couple
2.2] Structure sociale chez les espèces coloniales :
analyse de la diversité des associations
2.3] Relations intrasexe et succès d'appariement des individus
2.4] Apport des réseaux sociaux
pour l'étude des hiérarchies de dominance
2.5] Influence de la personnalité sur le réseau
2.6] Relations interspécifiques
3] Fonctionnalité des réseaux chez les oiseaux
3.1] Influence du réseau sur les mouvements collectifs
3.2] Influence du réseau sur la
transmission d'information et de parasites
3.3] Dynamiques de fission-fusion
3.4] Application de la théorie des réseaux à l'étude des chants
4] Conclusion
Chapitre 7 (page 205)
Nicolas Perony, Cédric Sueur & Gerald Kerth
La socialité complexe des chauves-souris
1] Les causes de la socialité des chauves-souris
2] Les conséquences de la socialité
3] Quelles implications pour la socialité animale en général ?
4] Conclusions
Chapitre 8 (page 233)
Marie-Hélène Pillot, Rémy Cazabet & Frédéric Amblard
Les ongulés
1] Vie en groupe
2] Dynamique de cohésion des groupes
2.1] Facteurs d'agrégation :
les types de groupes et les proximités intragroupes
2.2] Des associations intergroupes : communautés
2.3] Les populations structurées en unités socio-spatiales
3] Analyse d'un réseau d'isards
3.1] Objectifs
3.2] Matériels et méthodes
3.2.1] Description de l'espèce
3.2.2] Jeu de données
3.2.3] Périodes hivernales et estivales
3.3] Détection des réseaux chez les isards
3.3.1] Transformation des données
de co-observations en un réseau temporel
3.4] Avantages et inconvénients de la méthode
3.5] Interprétation des résultats
3.5.1] Communautés obtenues
3.5.2] Détail de l'évolution temporelle d'une communauté
3.5.3] Perméabilité des communautés
4] Conclusion
Chapitre 9 (page 261)
Julie Duboscq, Céline Bret & Sebastian Sosa
Primates non humains
1] Caractéristiques individuelles et réseau social
2] Décisions collectives, transmission d'information et réseaux
3] Affinités sociales, coopération et réseaux
4] Évolution des sociétés et réseaux
5] Conclusion
Chapitre 10 (page 291)
Mélanie Roy & Marc-André Selosse
Les réseaux mycorhiziens, des réseaux mutualistes
entre champignons et racines des plantes
1] Les mycorhizes : une interaction champignon(s)-plante(s) ?
1.1] Des associations mutualistes
1.2] Des associations mutualistes diffuses, multiples et variables
1.3] Des préférences plutôt qu'une spécialisation ?
2] Les champignons : des réseaux par nature
2.1] Qui sont ceux qui tissent ces réseaux sous nos pieds ?
2.2] Des hyphes aux réseaux
2.3] Au-delà de la racine, le sol et d'autres racines, encore
3] Nature, intensité et direction des flux dans les réseaux mycorhiziens
3.1] Des flux d'eau, de sels minéraux... et de matière organique !
3.2] Les mycohétérotrophes et la dépendance au réseau
3.3] Intensité et variabilité spatio-temporelle
des flux chez les mixotrophes
3.4] (Bi)directionnalité des flux
3.5] Des flux, dans tous les réseaux ?
4] Importance des réseaux mycorhiziens à l'échelle des écosystèmes
4.1] Partage des mycorhizes et plantes nourrices
4.2] Communication inter-plantes et
protection vis-à-vis des herbivores
4.3] Stabilité et dynamique
4.4] Structure des assemblages
et comparaison des réseaux écologiques
5] Conclusion
Chapitre 11 (page 329)
David Vogel
Les réseaux chez les myxomycètes
1] Méthodologie
2] Réseaux formés entre sources de nourriture
2.1] Entre deux sources de nourriture
2.2] Entre trois sources de nourriture
2.3] Entre de multiples sources de nourriture
2.4] Modélisation mathématique
3] Réseaux formés entre plasmodes
4] Conclusion
Chapitre 12 (page 343)
Julie Duboscq & Philipp Heeb
Pathogènes, parasites et
réseaux dans les sociétés animales
1] Rôle du réseau social sur les transmissions de pathogènes
2] Effets des pathogènes sur les réseaux sociaux
3] Transmission de pathogènes et systèmes d'appariement
Chapitre 13 (page 359)
Johann Mourier & Serge Planes
Structure des réseaux sociaux et diversité génétique
1] Mesures de génétique couramment utilisés
1.1] Coefficient d'apparentement (relatedness)
1.2] ADN mitochondrial et diversité haplotypique
1.3] Génétique quantitative
2] Diversité génétique dans les sociétés animales
2.1] Facteurs influençant la diversité
génétique au sein des groupes sociaux
2.2] Méthodes employées pour explorer les
liens entre structure des réseaux et diversité génétique
3] Application des réseaux sociaux combinés
à la génétique dans les sociétés animales
3.1] Primates
3.2] Autres mammifères terrestres
3.3] Mammifères marins
3.4] Pinnipèdes
3.5] Oiseaux
3.6] Reptiles
3.7] Poissons
3.8] Invertébrés
3.9] Synthèse
4] Directions futures
4.1] Vers une meilleure exploitation des
réseaux sociaux dans des sociétés hiérarchisées
4.2] Vers une meilleure intégration
des modèles de génétique quantitative
4.3] Déterminer les gènes régulant le comportement social
4.4] Effet de la transmission culturelle sur la diversité génétique
4.5] Réseaux génétiques
Chapitre 14 (page 407)
David Charbonneau, Sebastian Sosa,
Cristian Pasquaretta, Jean-Loup Guillaume
L'étude de l'émergence, de l'organisation et
de l'évolution des structures de réseau
par l'analyse de réseaux dynamiques
Introduction] Réseaux et réseaux temporels
1] Que savons-nous des réseaux temporels ?
1.1] Types de questions auxquelles on peut répondre
1.2] Revue des modèles utilisés
2] Réseaux dynamiques appliqués aux systèmes biologiques
2.1] Réseaux sociaux dynamiques
2.2] Directions futures : réseaux dynamiques et communautés
3] Conclusion
Chapitre 15 (page 423)
Cédric Sueur, Nicolas Perony,
Frédéric Amblard, Jean-Loup Guillaume
Modélisation des réseaux sociaux
1] Comprendre la complexité
2] Les systèmes multi-agents
3] Les avantages de la modélisation
des réseaux sociaux et les pièges potentiels
4] Les réseaux sociaux comme paramètres fonctionnels du modèle
5] Les réseaux sociaux comme paramètres d'étude du modèle
6] Considérations pratiques pour la modélisation des réseaux sociaux
7] Quelques exemples de modèles de réseaux
8] Limites de la modélisation
9] Discussion et perspectives
Chapitre 16 (page 445)
Cédric Sueur & Marie Pelé
Utilisation de l'analyse des réseaux sociaux
dans la gestion des animaux maintenus en captivité
1] Comprendre et analyser le
comportement social des populations captives
2] Utiliser l'analyse des réseaux
sociaux comme proxy du bien-être animal
3] Gérer les programmes de reproduction
4] Manipuler les groupes
5] Déterminer l'utilisation des ressources dans l'enclos
6] Prévenir la transmission des maladies
7] Conclusions
Chapitre 17 (page 469)
Cédric Sueur
Fonction et évolution des réseaux sociaux
1] Rôle fonctionnel du réseau dans
l'adaptation des individus à leur environnement
2] Réseau et partage d'information
3] Réseau et transmission des pathogènes
4] Compromis entre transmission
de l'information et transmission des pathogènes
5] Sélection des réseaux
6] Rôle de l'auto-organisation
7] Action combinée de la sélection et de l'auto-organisation
Les auteurs/Les résumés (page 487)
-
Mécanique quantique : et si Einstein et De Broglie avaient aussi raison ?
Michel Gondran, Alexandre Gondran
- Editions Matériologiques
- 1 Août 2014
- 9782919694990
SOMMAIRE
Introduction
Remerciements
Chapitre 1 - Histoire de l'interprétation de la mécanique quantique
1] Einstein et de Broglie, les deux pères de la dualité onde-particule
2] « Un coin du grand voile »
3] La mécanique des matrices de Heisenberg
4] L'équation de Schrödinger de la mécanique ondulatoire
5] Les premières interprétations
6] L'onde-pilote et la théorie de la double solution de Louis de Broglie
7] Le « concile » Solvay de 1927 et l'interprétation de Copenhague
8] Le théorème de von Neumann de 1932
9] La non-localité et l'expérience EPR de 1935
10] L'onde pilote retrouvée par Bohm en 1952
11] Le déterminisme et la réalité objective d'Einstein et de Broglie
12] Les interprétations actuelles de la mécanique quantique
13] Le langage et l'interprétation
Annexe 1 : Interprétation de l'onde-pilote de Broglie-Bohm
Chapitre 2 - Fentes de Young et dualité champ-particule
1] Simulation de l'expérience de Jönsson avec des électrons
2] Convergence de la mécanique quantique vers la mécanique classique
3] L'expérience des choix retardés de Wheeler
4] Expériences de deux sources indépendantes et interprétation champ-particule
5] Une dualité onde-particule en physique classique : les « marcheurs » de Couder
6] Une expérience cruciale : interférences dépendant de la taille des particules
7] Conclusion
Chapitre 3 - Les rayons lumineux de l'optique ondulatoire
1] Lignes de flux d'énergie et rayons diffractés de Newton
2] Les rayons lumineux de l'optique ondulatoire et quantique dans le vide
3] Conclusion
Chapitre 4 - Particule dans la boîte et trajectoires quantiques
1] La marche de potentiel
2] L'effet tunnel
3] La particule dans la boîte et la critique d'Einstein
Chapitre 5 - Décohérence et « mesure » du spin dans l'expérience de Stern et Gerlach
1] Temps de décohérence dans l'expérience de Stern et Gerlach
2] Impacts et quantification expliqués par les trajectoires
3] Réduction du paquet d'ondes et filtre de Stern et Gerlach
4] Conclusion sur la « mesure » du spin
5] L'ordinateur quantique est-il possible ?
Chapitre 6 - Expériences EPR, EPR-B et non-localité
1] L'expérience EPR
2] L'expérience EPR-B
3] Simulation et tests de la version séquentielle de l'expérience EPR-B
4] Interprétation causale de l'expérience EPR-B
5] Explication physique possible de la non-localité
6] Conclusion
Annexe 1 : Représentation réaliste de l'état singulet
Chapitre 7 - Convergence de la mécanique quantique vers la mécanique classique
1] Particules discernées et indiscernées en mécanique classique
2] Convergence vers des particules indiscernées
3] Convergence vers des particules discernées
4] Conclusion
Annexe 1 : Équations statistiques d'Hamilton-Jacobi
Annexe 2 : Équation de Schrödinger
Chapitre 8 - Collisions, indiscernabilité d'interaction et théorème spin-statistique
1] Collision de deux particules classiques indiscernées
2] Indiscernabilité et discernabilité en mécanique classique
3] Convergence de l'indiscernabilité quantique quand h tend vers 0
4] Une interprétation possible du théorème spin-statistique
5] Conclusion
Chapitre 9 - L'atome d'hydrogène
1] De l'atome de Bohr à l'équation de Schrödinger
2] La critique de Pauli et d'Heisenberg sur les trajectoires de Broglie
3] Les états circulaires et elliptiques de l'atome d'hydrogène
4] Le « rêve » de Schrödinger : les états périodiques non dispersifs de Floquet
5] Interprétation uniquement statistique de la fonction d'onde de Schrödinger dépendante du temps
6] Les transitions dans les différentes interprétations
7] Conclusion
Annexe 1 : La représentation de Foldy-Wouthusen
Annexe 2 : Les ordres de grandeur dans l'atome d'hydrogène
Chapitre 10 - Les interprétations de la relativité
1] La relativité avant Einstein
2] La relativité restreinte d'Einstein
3] La relativité de Lorentz-Poincaré
4] La relativité restreinte sans le postulat sur l'invariance de la vitesse de la lumière
5] L'éther de la relativité générale d'Einstein
6] La relativité générale fondée sur un référentiel privilégié
7] Conclusion
Conclusion
Glossaire -
De la démocratie dans les sciences
Léo Coutellec
- Editions Matériologiques
- 29 Mars 2018
- 9782919694174
Pour une renouvellement éspitémologique
Sans répit, nous assistons aux collusions fatales entre certaines façons de faire de la science et les industries ou les États soumis aux règles d'airain du profit. Cette science dévoyée, abandonnant l'idée d'une exploration du monde pour l'honneur de la connaissance, tend à remplacer dans les têtes comme dans les instances de décision une science éthiquement responsable. Cette situation ne peut que s'aggraver, si l'on n'y prend pas garde et si l'on ne se munit pas d'outils idoines pour y faire face. Issues de la science fondamentale ou dûment inventées pour des buts précis, les techniques les plus bouleversantes, anthropologiquement parlant, sont déjà présentes ou susceptibles d'être mises au point dans quelques années. Ces techniques sont là tandis que les moyens d'en comprendre tous les tenants et aboutissements et de les circonscrire sont sous-développés. L'ouvrage de Léo Coutellec se veut une contribution pour repenser les rapports entre sciences et éthiques, et ainsi avancer vers ce qu'il appelle une « démocratie épistémique ». En démontrant l'insoutenabilité d'une science contre l'Homme, la visée est de réunir-sans-unifier ce qui, dans la science, est de l'ordre de l'épistémique, du technique et de l'éthique. Pour ce faire, l'auteur procède par étapes, travaillant préalablement et en profondeur sur deux espaces? : épistémologique et éthique. Il ne saurait être question de la fin de l'épistémologie mais de la nécessité de son renouvellement. Celui-ci passera, et il s'agit là de la thèse principale de cet ouvrage, par de nouveaux rapports avec l'éthique. L'auteur donne à cette thèse le nom d'« intégrité épistémique et éthique des sciences ». En épistémologie, il s'agit d'identifier et de reconnaître la matérialité plurielle constitutive des sciences. Avec l'hypothèse d'un « pluralisme épistémique ordonné et cohérent », Léo Coutellec démontre que la pensée épistémologique associée aux sciences et aux techniques contemporaines ne se résume pas à une opposition entre positivisme et relativisme.
L'ouvrage de Léo Coutellec se veut une contribution pour repenser les rapports entre sciences et éthiques, et ainsi avancer vers ce qu'il appelle une « démocratie épistémique »
EXTRAIT
De façon générale, l'éthique évolutionniste cherche à introduire le point de vue de l'évolution dans les débats sur l'origine et la justification morale. Elle s'inspire de la biologie évolutive, de la théorie des jeux, de la neurobiologie et d'autres domaines scientifiques pour aborder des questions traitées en philosophie morale. Ainsi, selon les partisans de l'éthique évolutionniste, « les valeurs et normes morales peuvent trouver un ancrage dans les données factuelles ; elles dépendraient directement de la manière dont la nature nous a façonnés ». Nos jugements ou comportements moraux seraient donc le produit de la sélection naturelle, inscrits dans une « nature humaine », un ensemble de propriétés biologiques de l'être humain. La morale est alors considérée soit comme une propriété intrinsèque à la nature humaine, soit comme une fonction biologique, soit comme un paramètre adaptatif.
À PROPOS DE L'AUTEUR
Léo Coutellec est chercheur et enseignant en philosophie des sciences et des techniques à l'Insa (Institut national des sciences appliquées) de Lyon et à la faculté de philosophie de Lyon?3. Il travaille actuellement au renouvellement de la pensée épistémologique dans ses liens avec l'éthique. Ses recherches visent à définir les conditions d'une démocratie épistémique et s'articulent autour de la question suivante?: sous quelles conditions l'intégrité des sciences peut-elle être tout autant épistémique qu'éthique?? -
Une réflexion approfondie sur le lien unissant la chimie et le matérialisme
La chimie a longtemps été délaissée par la philosophie et l'histoire des sciences. Elle offre pourtant de riches perspectives, en particulier pour la réflexion sur le matérialisme. Elle peut tout d'abord servir de ressource pour argumenter une thèse matérialiste, comme le montre son usage par plusieurs penseurs matérialistes classiques (Gassendi, Diderot, d'Holbach). N'est-elle pas par excellence un savoir se prêtant à des analyses matérialistes, voire une science développant par son étude de la matière une sorte de matérialisme spontané ? Pourtant, elle a aussi pu être exploitée par des adversaires du matérialisme, devenant un terrain d'affrontement philosophique. Mais son rôle le plus intéressant semble la manière dont la chimie rénove le questionnement matérialiste. Loin d'être une simple source de résultats exploitables, la chimie permet un nouveau rapport à la matière, plus opérationnel et pratique. L'accent sur la matière, ses forces et ses qualités est d'ailleurs un trait non trivial du matérialisme chimique. Le matérialisme peut-il par la chimie (re)devenir une philosophie de la matière ? Y a-t-il un matérialisme spécifiquement chimique ? La chimie invite la réflexion philosophique à prendre en considération les cultures expérimentales et pratiques, l'effort théorique mais aussi l'imaginaire développés au sein du travail de la matière. Ce livre collectif s'intéressera aux questions originales que la chimie fait naître, en articulant la philosophie, l'histoire des sciences (de l'alchimie au XXIe siècle) et un état des lieux sur certains travaux de la science contemporaine.
Ce livre collectif s'intéressera aux questions originales que la chimie fait naître, en articulant la philosophie, l'histoire des sciences et un état des lieux sur certains travaux de la science contemporaine.
EXTRAIT
La chimie vue comme une frontière d'organisation de la matière (en tant qu'elle délimite une certaine échelle d'espace, de temps et d'énergie pour les objets et les phénomènes qu'elle considère), rencontre naturellement cette autre frontière incertaine entre vivant et inanimé, en particulier autour de l'échelle moléculaire. La phénoménologie chimique repose aussi implicitement sur l'absence de niveau intermédiaire entre l'échelle moléculaire et l'échelle macroscopique (collectif homogène d'entités toutes identiques).
À PROPOS DES AUTEURS
François Pépin est philosophe, rattaché à l'Université de Nanterre-Paris Ouest (IREPH), pécialiste des Lumières, de la théorie de la connaissance et de l'épistémologie de la chimie. Sous sa direction, plusieurs auteurs ont contribué à la rédaction de cet ouvrage : Laurent Boiteau, François Henn, Bernard Joly, Jean-Pierre Llored, François Pépin, Luc Peterschmitt et Joachim Schummer. -
Le vivant critique et chaotique
Nicolas Glade, Angelique Stephanou
- Editions Matériologiques
- 1 Août 2015
- 9782919694945
[Table des matières]
Introduction (page 7)
Nicolas Glade & Angélique Stéphanou
Le critique et le chaotique,
essences de l'adaptabilité et de la robustesse du vivant
Chaos déterministe et hasard
Évolution et robustesse
Chaos pathologique et chaos déterministe
Criticité et criticalité
De l'importance de l'hétérogénéité
De la spatialité à l'historicité
Chapitre 1 (page 21)
Franck Varenne
Diversité des biologies théoriques
face aux complexités du vivant
1] Préambule sur les mathématisations avant 1920
1.1] Les mathématisations en biologie :
une classification de Volterra
1.2] Ancienneté de la théorisation mathématique
2] D'Arcy Thompson : une biomécanique
2.1] La biomécanique comme science mixte minimale
2.2] Les hypothèses épistémologiques de d'Arcy Thompson
2.3] Pourquoi recourir aux mathématiques en biologie théorique ?
3] Lotka : une biologie physique
3.1] Biophysique et biologie physique
3.2] Une biologie physique énergétiste
4] Woodger : une biologie axiomatique
4.1] Vers des « principes biologiques »
4.2] Le « vitalisme méthodologique » de Woodger
4.3] Un système axiomatique pour la biologie :
le système (P, T, org, U,...)
4.4] Représenter une augmentation
de complexité sans recours au vitalisme
5] Rashevsky-1 : une biophysique
5.1] Épistémologie physicaliste et « théories physico-mathématiques »
5.2] Deuxième épistémologie : fonctionnalisme et « principes formels »
6] Rashevsky-2 : une biotopologie
7] Rosen-1 : une biologie « catégoriale »
7.1] Approche des graphes par des diagrammes de bloc
7.2] Approche catégoriale des graphes
8] Rosen-2 : une biologie théorique antimécaniste
9] Un essai de synthèse comparative
10] Conclusion
Chapitre 2 (page 73)
Maël Montévil
Changements de symétrie, criticité et aléatoire :
mathématiques et objectivation du vivant
1] Géométrie du temps des mammifères
1.1] Introduction
1.2] Allométries
1.3] Géométrie du temps biologique
1.4] Structure de la variabilité du temps biologique
1.5] Bilan
2] Phénomènes et mathématiques en physique
2.1] Symétries
2.2] Constitution théorique des objets physiques
2.3] Changements de symétries en physique et criticité
3] Le cas des objets biologiques
3.1] Hypothèse
3.2] Les objets biologiques
4] Stabilités chez le vivant
4.1] Les symétries comme contraintes
4.2] La mesure en biologie
5] Conclusion
Chapitre 3 (page 99)
Jacques Demongeot
De la stabilité des systèmes dynamiques modèles du vivant
1] Définitions de la stabilité et de la robustesse
1.1] Définition de la stabilité trajectorielle
et de la stabilité asymptotique
1.2] Définition de la stabilité structurelle
1.3] Définition de la résilience, de la résistance et de la robustesse
1.4] Définition des systèmes potentiels, hamiltoniens et mixtes
2] Exemples de réseaux de régulation asymptotiquement
stables, résistants et robustes, ou non
2.1] Exemple d'un réseau de régulation métabolique potentiel asymptotiquement stable en morphogenèse
2.2] Exemple d'un réseau de régulation conservatif immunologique non asymptotiquement stable
2.3] Exemple d'un réseau de régulation physiologique mixte asymptotiquement stable
2.4] Exemple d'un réseau de régulation métabolique mixte asymptotiquement stable
2.5] Exemple d'un réseau de régulation neuronale robuste
2.6] Exemple d'un réseau de régulation génétique asymptotiquement stable, non résistant
2.7] Exemple d'un réseau de régulation écologique non asymptotiquement stable, ni robuste
2.8] Exemple d'un réseau de régulation génétique asymptotiquement stable, non robuste
3] Les molécules de la stabilité et de la robustesse :
microARN, mitomiR et chloromiR
3.1] Rôle des microARN dans l'architecture des réseaux
de régulation génétique
3.2] MicroARN et horloge chromatinienne
3.3] MicroARN et énergétique cellulaire
3.4] MicroARN, morphogenèse et cycle cellulaire
3.5] MicroARN mitochondriaux
3.6] MicroARN chloroplastiques
3.7] MicroARN et cancer
3.8] MicroARN et pathologie infectieuse
4] Architecture générale d'un réseau
de régulation génétique et robustesse
5] Perspective : rôle de l'évolution.
Exemple : régulation du métabolisme du fer
6] Conclusion
7] Annexe mathématique
7.1] Définition mathématique d'un réseau et propriétés dynamiques
7.2] Approximation de la distance de Hamming circulaire
Chapitre 4 (page 159)
Jean-Pierre Françoise & et Marion Lahutte-Auboin
Systèmes multi-échelles impulsionnels
au voisinage de leur courbe critique
1] Le contexte biologique : le rôle du lactate en physiologie,
un nouveau paradigme
2] Modèle pour l'échange des flux de lactate
2.1] Échanges à travers l'unité fonctionnelle « vasculaire-interstitiel-cellulaire »
2.2] Points stationnaires du système et isocline lente
2.3] Courbe critique et portrait de phase
3] Discussion sur les paramètres
3.1] Limitations physiologiques de l'espace de phase
3.2] Limites physiologiques des paramètres
3.3] Simulations numériques
4] Modèle avec stimulations
4.1] La théorie des bifurcations
4.2] Le système forcé avec un terme de contrôle
4.3] Choix d'un forçage impulsionnel
et explication géométrique de la déflexion
4.4] Accrochage des fréquences
5] Conclusions et perspectives
Chapitre 5 (page 179)
Arnaud Chauvière & Fernando Peruani
Auto-organisation et agrégation
cellulaire sans chimiotactisme
Instabilités, ordre et désordre associés à la densité
1] Modèle discret d'auto-organisation et d'agrégation cellulaire
2] Modèles continus à deux vitesses
pour la formation d'agrégats cellulaires
2.1] Modèle de migration cellulaire en milieu fibreux
2.2] Modèle minimal pour la formation d'agrégats cellulaires statiques : influence des phases d'immobilité dans une dynamique multicellulaire
3] Généralisation à un modèle continu avec distribution de vitesses
4] Conclusion
Chapitre 6 (page 199)
Bertrand Caré, Amanda Lo Van,
Hugues Berry, Hédi Soula
Signalisation sous contraintes spatiales
Conséquences sur les conditions de stabilité
et de bifurcation
1] Impact du clustering membranaire : cas « overstacked »
2] Situation plus réaliste : récepteurs contigus
3] Hit & Run Pathway
4] Clustering et oscillateur : bifurcation induite par l'espace
5] Discussion
Chapitre 7 (page 223)
Nicolas Glade, Olivier Bastien & Hessam Hessami
Phénomènes critiques en épidémiologie :
résistance, spatialité, dynamiques humaines
Des modèles aux applications
1] Introduction
1.1] Historique et motivations
1.2] Données nouvelles, motivations nouvelles
2] Cinétiques et mesures
2.1] Cinétique SI avec délai (sans résistance)
2.2] Cinétique SIR (avec résistance)
2.3] Dynamique des groupes dans une population
2.4] Mesures
2.4.1] Indicateurs globaux obtenus à partir des cinétiques
2.4.2] Micro et macro-événements
2.4.3] Charges : charge infectieuse, charge sanitaire, charge de réserve
2.4.4] Charges et criticalité comme signatures des maladies
2.4.5] Utilisation des connaissances fines sur la dynamique infectieuse
3] Modèles numériques
3.1] Modèles spatialisés, modèles stochastiques
3.2] Modélisation continue à EDO (espace
globalement homogène) et EDP (espace localement homogène)
3.3] SSA en temps continu (SSA-H et SSA-G)
3.4] SSA en temps discret (SSA-AC et SSA-G)
3.5] Systèmes multi-agents à groupes (SMA-G)
4] Comportements critiques et oscillatoires
4.1] Structure des populations :
organisation globale et organisation locale
4.2] Limitations des épidémies liées à la dynamique SIR
5] Perspectives de modèles-outils pour l'épidémiologie
Annexe A] Dynamiques SI et SIR
A.1] Dynamique SI à délai (sans résistance)
A.2] Dynamique SIR (avec résistance)
A.3] À propos des équations de conservation [S]tot
Annexe B] Surface effective
Chapitre 8 (page 293)
Sabir JACQUIR, Binbin XU,
Stéphane BINCZAK, Jean-Marie BILBAULT
Détection d'anomalie dans les signaux physiologiques
1] De la membrane biologique à l'activité électrique
1.1] Fonctions de la membrane plasmique
1.2] Constituants moléculaires des membranes
1.2.1] Résistance membranaire au repos
1.2.2] Capacité membranaire
1.3] Mécanismes des canaux ioniques
1.4] Courants ioniques transmembranaires
1.4.1] Courant de conduction
1.4.2] Courant de diffusion
1.5] Échanges ioniques au niveau de
la cellule (exemple de la cellule cardiaque)
1.6] Champ de potentiel extracellulaire et potentiel d'action
1.7] Théorie du câble
2] Observation expérimentale des signaux électriques cardiaques
2.1] Modèle expérimental
2.2] Champs de potentiels extra-cellulaires
2.3] Classification de signaux
3] Conditions expérimentales
3.1] Cardiomyocytes en conditions basales
3.2] Cardiomyocytes soumis à une stimulation électrique
4] Approches de traitement et
d'analyse non linéaires des données physiologiques
4.1] Qualification de la non-linéarité dans les données physiologiques
4.2] Diagramme de bifurcation
4.3] Diagramme de Poincaré
5] Reconstruction de l'espace de phase
à partir des données expérimentales
5.1] Dimension de plongement m
5.2] Décalage temporel t
5.2.1] t par la fonction d'autocorrélation
5.2.2] t par l'information mutuelle
5.2.3] t en fonction de m
5.3] Espace de phase
6] Conclusion
Chapitre 9 (page 333)
Véronique Thomas-Vaslin
Complexité multi-échelle du système immunitaire :
évolution, du chaos aux fractales
1] Évolution du système immunitaire et concepts
1.1] Système complexe interactif :
organisme polygénomique, environnement et système immunitaire
1.1.1] Organisme polygénomique
1.1.2] Le système immunitaire et son environnement
1.2] Bases conceptuelles théoriques en biologie et mathématiques
1.3] Hypothèse d'émergence de l'auto-organisation
arborescente multi-échelle du vivant et du système immunitaire
1.3.1] Évolution des espèces et
universalité fonctionnelle du système immunitaire
1.3.2] Organisation arborescente dans le temps
et l'espace : des écosystèmes aux immuno-récepteurs
o Organisation arborescente du vivant
o Organisation arborescente de l'organisme
o Dissipation d'énergie et allométrie
1.3.3] Structuration d'un système contraint. Émergence, diversité
1.4] Développement et organisation
du système immunitaire : créativité et sélection
1.4.1] Interface fractale de la cognition immuno-récepteur/antigène
1.4.2] Diversité somatique des immuno-récepteurs
1.4.3] « Immunoception » de l'environnement et identité temporelle
1.4.4] Différenciation et sélection thymique des lymphocytes T
Répertoires et diversité
o Sélection des répertoires
o Autoréactivité et tolérance dominante
1.4.5] Réponse immunitaire et contrôle
1.4.6] Stabilité relative - compétition et diversité
1.4.7] Historicité du système - transmission de caractères acquis
1.4.8] Mémoire immunologique
1.4.9] Résilience du système immunitaire
1.5] Vieillissement du système immunitaire :
imprédictibilité et désorganisation
1.5.1] Désorganisation multi-échelle
1.5.2] Rythmes biologiques et composante du temps
1.5.3] Oscillations chaotiques et
attracteurs dans le système immunitaire
1.5.4] Instabilité, chaos, boucles de rétroaction :
conséquences sur la dynamique des systèmes vivants
1.6] Interprétation fractale-like du système immunitaire
1.6.1] Construction/déconstruction et autocohérence
1.6.2] Trajet hyperbolique dans l'espace et le temps
1.6.3] Arborescence, dégénérescence et
conservation de l'identité et de l'intégrité systèmes vivants
1.7] Conclusions
2] Observations expérimentales
et modélisation du système immunitaire
2.1] Approches qualitatives et quantitatives du système immunitaire
2.1.1] Populations lymphocytaires et évolution au cours du temps
2.1.2] Vieillissement, variabilité, diversité
o Diversité et variabilité multi-échelle en
fonction du vieillissement et du fond génétique
o Sources de variabilité : augmentation
de la variabilité avec le vieillissement
o Score de diversité et de perturbation du
répertoire lymphocytaire au cours du vieillissement
o Prolifération lymphocytaire et vieillissement
2.2] Déplétion transitoire du système
2.3] Modélisations dans le temps et l'espace
2.3.1] Modélisation in silico linéaire déterministe
ou stochastique de la différenciation des thymocytes
o Modélisation non linéaire et
boucles de rétroaction lors de réponse immunitaire
3] Perspectives
Auteurs, résumés & abstracts (page 403)
-
Qu'est-ce que la technologie ?
Raynaud Dominique
- Editions Matériologiques
- 1 Février 2016
- 9782373610437
[Table des matières]
Remerciements (page 4)
Préface de Mario Bunge (page 5)
Introduction (page 13)
1] Approche générale de la technologie
2] Objectif de l'enquête
3] Plan du livre
Chapitre 1, Science, technique, technologie (page 21)
1] Définitions
1.1] Technique et technologie
1.2] Science et technologie
2] Termes dérivés
2.1] Artefact technologique
2.2] Procédé technologique
2.3] Raisonnement technologique
2.4] Innovation technologique
2.5] Degrés de nouveauté
2.6] Obsolescence technologique
2.7] Technodiversité
3] Pensées classiques de la technique
3.1] Technophilie et technophobie
Jacques Ellul
Jürgen Habermas
4] Nouvelles approches de la technologie
4.1] La question axiologique
4.2] La rupture
4.3] Approche empirique et analytique
Chapitre 2, Obstacles à l'étude de la technologie (page 57)
1] Multiplicité des rapports de mise en oeuvre
1.1] Type A1. Connaissance réfutée
1.2] Type A2. Connaissance incertaine
1.3] Type B1. Connaissances sans application
1.4] Type B2. Technique non dérivée de la science
1.5] Type B3. La pratique, prétexte d'un exercice théorique
1.6] Type B4. Application modifiant la connaissance théorique
1.7] Type C1. Délai motivé par la difficulté à trouver une utilité
1.8] Type C2. Délai motivé par la croyance infondée dans l'inutilité
1.9] Type C3. Nocivité de l'application réputée utile
1.10] Type C4. Application limitée à d'autres sciences
2] Les transitions technique D technologie
2.1] Mutations technologiques (technique ? technologie)
2.2] Régressions techniques (technologie ? technique)
2.3] L'autonomisation de la technique sans Ellul
3] Conclusion
Chapitre 3, Technologie et changement non finalisé (page 87)
1] Cas 1 : L'invention du ciment artificiel
2] Cas 2. La CDAO et la révolution informatique
3] Espoirs et craintes des années 1980
4] Analyses rétrospectives
4.1] Impact sur la profession
4.2] Impact sur la conception
4.3] Impact sur le dessin
4.4] Impact sur les bâtiments
5] Évaluer les mutations technologiques
6] Conclusion
6.1] Téléologie, téléonomie et changement non finalisé
6.2] Hasard et technologies adaptatives
Chapitre 4, Technologie et connaissance (page 109)
1] Une mutation du mode de production des connaissances ?
1.1.] Contextualisation
1.2] Transdisciplinarité
1.3] Délocalisation
1.4] Contrôle qualité
2] Les Laboratoires Bell
2.1] L'usine à Nobel
2.2] Une recherche fondamentale et appliquée
2.3] La fin des Bell Labs ?
2.4] La science appliquée aux États-Unis
2.5] La science appliquée en Europe
3] Deux réalisations technologiques récentes
3.1] Le télescope de Schwarzschild-Couder
3.2] L'oeil bionique
4] Conclusion
Chapitre 5, Technologie et travail (page 141)
1] Aristote et les pratiques prudentielles
2] Technologie et phrónesis
2.1] Information lacunaire
2.2] Hypothèses incertaines
3] Science et phrónesis
3.1] Les mathématiques contemporaines
3.2] Comparaison
3.3] La découverte du boson de Higgs
3.4] L'organisation du travail au CERN
3.5] Comparaison
4] Le cas particulier des start-up
5] Conclusion
Chapitre 6, Technologie et professions (page 163)
1] L'axiologie scientifique
1.1] Max Weber
1.2] Robert K. Merton
1.3] Norman Storer
1.4] Eliot Freidson
2] Pratiques contemporaines
2.1] Des mathématiciens plus hétéronomes ?
2.2] Des ingénieurs plus autonomes ?
3] Retour sur le concept d'autonomie
3.1] Redéfinir l'autonomie
3.2] Le Second Empire autoritaire
4] Conclusion
Chapitre 7, Technologie et droit (page 195)
1] Régimes de la propriété intellectuelle
1.1] La propriété littéraire et artistique
1.2] La propriété industrielle
2] Les interfaces science D technologie
2.1] Notions de public et privé
2.2] Technologies de recherche et de marché
2.3] Transition privé/public
2.4] Transition public/privé
2.5] Frontière stable public/privé
2.6] Frontière instable public/privé
3] Conclusion
Chapitre 8, Technologie et communication (page 227)
1] Effets de propagande
1.1] Extension des nanotechnologies
1.2] Les brevets
1.3] Technologies et biais cognitifs
2] Les technologies invisibles
2.1] Classe 1. Technologie non développée
2.2] Classe 2. Technologie de grande diffusion occultée
2.3] Classe 3. Technologie de faible diffusion occultée
2.4] Classe 4. Technologie asservie, stable et de grande
diffusion
2.5] Classe 5. Technologie asservie, stable et de faible diffusion
2.6] Classe 6. Technologie asservie transitoire
2.7] Classe 7. Technologie doublement asservie stable
2.8] Classe 8. Technologie doublement asservie transitoire
3] Conclusion
Conclusion (page 259)
1] Technologie et démographie
Post-scriptum sur la technoscience (page 273)
1] Histoire du mot « technoscience »
1.1] Occurences actuelles
1.2] Occurrences historiques
2] Critique de la technoscience
2.1] Le mot « technoscience » a un périmètre indéfini
2.2] Le mot « technoscience » est fondé sur une relation
inclarifiable
2.3] Le mot « technoscience » ne décrit pas un phénomène
nouveau
2.4] Le mot « technoscience » a un contenu émotionnel
2.5] Le mot est peu connu des scientifiques et des ingénieurs
2.6] Le mot « technoscience » est utilisé par une communauté
restreinte
2.7] L'usage du mot « technoscience » est en déclin
3] Conclusion
Achevé d'imprimer en février 2015 par l'imprimerie Laballery,
Rue Louis Bleriot, 58502 Clamecy, France.
Dépôt légal : février 2015.
-
Nouveau regard sur les cellules souches
Jean-pascal Capp
- Editions Matériologiques
- 1 Décembre 2015
- 9782373610369
[Table des matières]
Remerciements (page 3)
Préface de Thomas Heams (page 5)
Introduction (page 9)
Chapitre 1 (page 17)
Qu'est-ce qu'une cellule souche ?
Histoire et actualité d'un concept
1] Aux origines : du XIXe siècle au milieu du XXe siècle
1.1] Cellule souche et lignée germinale
1.2] Cellule souche et hématopoïèse
1.3] Cellule souche et cancer
1.4] Cellule souche et potentialité de différenciation
2] Années 1960 : les débuts de l'ère moderne
2.1] Découverte des cellules souches hématopoïétiques
2.2] Étude des tératomes, tératocarcinomes et carcinomes
embryonnaires
3] Premières purifications et caractérisations moléculaires
de cellules souches
3.1] Isolement et caractérisation moléculaire des
cellules souches hématopoïétiques
3.2] Des cellules EC murines aux cellules ES humaines
4] Années 2000 : une tentative de définition moléculaire des
cellules souches
4.1] Des voies et des gènes propres aux cellules souches
4.2] Rôle des niches pour les cellules souches adultes
4.3] Réémergence de la notion de cellule souche cancéreuse :
aspects moléculaires et cellulaires
5] Années 2010 : une nouvelle conception émerge
5.1] Des révolutions technologiques pour une révolution
conceptuelle
5.2] Cellule souche : un état plutôt qu'une identité
5.3] Dynamique du génome et de l'épigénome
5.4] Cellule souche cancéreuse : une théorie très discuté
Chapitre 2 (page 75)
Différenciation des cellules souches : l'ontophylogenèse comme réponse à la crise du programme génétique
1] Le modèle de différenciation classique
basé sur la notion de programme génétique
1.1] Un modèle déterministe et instructif issu
du modèle de l'opéron
1.2] Contemporanéité du modèle instructif : rôle de l'épigénétique
2] Crise du modèle déterministe
2.1] Au niveau cellulaire : différenciation cellulaire
aléatoire, dédifférenciation, transdifférenciation
2.2] Au niveau moléculaire :
expression stochastique des gènes et différenciation
2.3] Une tentative de modèle alternatif
stochastique : Huang, Kaufmann, Kaneko
3] Un modèle sélectif de type darwinien : l'ontophylogenèse
3.1] « Hétérostabilisation »
3.2] Ontophylogenèse
3.3] Rôle des interactions et de la signalisation cellulaire
3.3.1] La différenciation épiblaste/endoderme primitif
chez la souris
?.?.?] Morphogènes et autres systèmes développementaux
3.4] Cycle cellulaire, facteurs de croissance, niche et quiescence
3.5] Cancer
Chapitre 3 (page 129)
Nouvelle perspective sur la
« reprogrammation » cellulaire
1] Méthodes classiques d'obtention de cellules
souches embryonnaires et leurs problèmes
1.1] À partir d'embryons issus de fécondation in vitro
1.2] Reprogrammation par transfert nucléaire
1.3] Fusion cellulaire
2] Les cellules souches induites
2.1] Principe et processus
2.2] Problèmes
2.3] Différenciation « dirigée » des cellules souches induites
3] Reprogrammation directe par transdifférenciation
4] Nouvelle perspective : la reprogrammation selon l'ontophylogenèse
4.1] Cellules souches induites
4.2] Reprogrammation par transfert nucléaire
4.3] Fusion cellulaire
4.4] Différenciation « dirigée »
4.5] Reprogrammation par transdifférenciation
Chapitre 4 (page 175)
Nouvelle perspective sur la médecine régénérative
1] Utilisation de cellules souches à des fins thérapeutiques
1.1] Exemples de régénération tissulaire naturelle
1.2] L'idée de thérapie cellulaire par des cellules souches
pluripotentes pour la médecine régénérative
1.3] Avantages et inconvénients des différents types
de cellules souches pluripotentes en médecine régénérative
1.4] Des cellules souches pour traiter quelles maladies ?
1.5] Autres utilisations des cellules souches
pluripotentes à des fins thérapeutiques
2] La médecine régénérative par les
cellules souches vue de l'ontophylogenèse
2.1] Aperçu de quelques problèmes
2.2] Modulation de la niche des cellules souches endogènes
Conclusion (page 195)
Sigles et glossaire (page 199)
-
Essais précoces en cancérologie ; éthique et justice
Collectif
- Editions Matériologiques
- 1 Mai 2017
- 9782373611106
Table des matières
Présentation (page 9)
Valérie Gateau, François Doz, Philippe Amiel
Paysage scientifique et institutionnel
Chapitre 1 (page 15)
Angelo Paci Médecine personnalisée en cancérologie et essais précoces
1] La médecine personnalisée en cancérologie
2] Les thérapies moléculaires ciblées
3] La révolution des biomarqueurs
4] Enjeux médico-économiques
5] L’accès aux médicaments innovants et aux tests de biologie moléculaire
6] Conclusion
Chapitre 2 (page 31)
Béatrice Bussière, Antoine Hommais,
Guy-Robert Auleley Initiatives et actions de soutien de l’Institut national du cancer aux essais cliniques précoces
1] Soutien aux investigateurs d’essais cliniques précoces : labellisation des centres académiques d’essais cliniques de phase précoce
2] Accès aux molécules innovantes auprès des firmes installées aux États-Unis à travers la collaboration entre l’INCa et le NCI
3] Accès aux molécules innovantes auprès des firmes pharmaceutiques en France : collaboration INC-laboratoires pharmaceutiques
4] Conclusion
Addendum
Questions de méthode
Chapitre 3 (page 49)
Jean-Claude K. Dupont, François Doz La notion de personne dans la « médecine personnalisée »
1] De la « personnalisation » à la « précision » : contexte épistémologique d’un changement de vocable
2] Ciblage et individualisation des soins : quelles conséquences pour une distinction philosophique salutaire ?
3] Conclusion
Chapitre 4 (page 73)
Edwige Rude-Antoine Apports de l’interdisciplinarité
1] La juxtaposition des disciplines
2] Une discipline nourrie par des facteurs externes issus d’autres discipliness
3] L’intégration entre champs disciplinaires
Contributions au débat
Chapitre 5 (page 83)
Sylvain Besle Les réseaux d’appariements dans les essais précoces en cancérologie
1] Inclure les patients dans les essais précoces
1.1] Le choix des patients
1.2] L’inclusion comme appariement
2] Un marché des essais précoces inexistant
2.1] Le choix des essais précoces
2.2] Des essais singuliers
2.3] Des appariements sans marché
2.4] L’accès aux essais en dehors du marché
3] Un réseau d’appariements
3.1] Un réseau de médecins
3.2] Caractéristiques structurelles
3.3] L’influence des patients sur le réseau d’adressage
4] Conclusion
Chapitre 6 (page 109)
Valérie Gateau Inégalités et injustices dans l’accès aux essais précoces en cancérologie : qui est le gatekeeper ?
1] Recherche et soin : protection vs accès
2] Entre justice comme protection et justice comme accès : le cas des essais précoces en cancérologie
3] Modèles de la justice dans la recherche
4] Inégalités, injustices et gatekeeping
Chapitre 7 (page 129)
Roberto Merrill Essais précoces en cancérologie : pas de paternalisme, mais moins de justice ?
1] L’éthique des essais précoces : trois questions
2] Un argument paternalisme contre les essais précoces
3] Deux objections
3.1] Objection du mauvais jugement
3.2] Objection des libertés fondamentales
4] Pas de paternalisme mais moins de justice ?
5] Conclusion
Chapitre 8 (page 143)
Anne Fagot-Largeault Les essais précoces et la distinction soins/recherche
Chapitre 9 (page 165)
Philippe Amiel Essais précoces et droit des personnes à la recherche : l’apport de la loi Jardé
1] La loi Jardé : principales dispositions
1.1] Une nouvelle catégorisation des recherches fondée sur le niveau de risque
1.2] Autres dispositions
2] L’apport de la loi à la reconnaissance d’un droit de participer aux essais
2.1] L’évolution en marche du rapport aux essais
2.2] La contribution de la loi Jardé à la reconnaissance d’un droit de participer aux essais
-
Les sciences naturelles à Rouen au XIXe siècle ; muséographie, vulgarisation et réseaux scientifiques
Bénédicte Percheron
- Editions Matériologiques
- 13 Septembre 2017
- 9782373611229
Pr?face
Guillaume Lecointre
Mus?um national d'histoire naturelle
?tudiant, j?ai fr?quent? r?guli?rement le mus?e d?histoire naturelle de Rouen, comme je fr?quentais ce type de mus?es chaque fois que l?occasion s?en pr?sentait. Je restais frapp? par l?obsolescence des contenus scientifiques, alors que ceux-ci enveloppaient de leurs discours surann?s des objets remarquables par leur raret?, leur beaut?, leur ?tranget?, leur puissance ?vocatrice ou leur incitation au questionnement, voire m?me au r?ve. Toute la puissance de l?histoire naturelle se trouvait l? r?unie par la fascinante force des sp?cimens, mais comme laiss?e ? l?abandon par l?intellect. Il en allait de m?me pour d?autres mus?es d?histoire naturelle en France, y compris de certaines galeries du Mus?um national. Pourtant, les mus?es d?histoire naturelle ont ?t? et restent des mus?es populaires. Que s??tait-il pass? ? Pourquoi cet abandon ? En parall?le, de nouveaux types de mus?es ou d?expositions temporaires voyaient le jour, forts de dispositifs mus?ographiques sophistiqu?s et pr?sent?s comme ? la pointe, forts de messages ? faire passer, mais d?connect?s d?objets, de sp?cimens r?ellement issus du monde naturel. J?en venais ? souhaiter de toutes mes forces un mus?e d?histoire naturelle dont la puissance ?vocatrice des sp?cimens r?els soit au service d?un contenu scientifique moderne. Fort heureusement, plusieurs r?novations spectaculaires de mus?es d?histoire naturelle fran?ais entre 1994 et 2014 ont relev? ce d?fi. Mais il reste du chemin ? parcourir. Je ne peux que souhaiter qu?il en soit de m?me pour le Mus?um de Rouen, ainsi que pour certaines galeries du Mus?um national.
La riche r?trospective historique pr?sent?e ici par B?n?dicte Percheron nous montre que l?histoire naturelle en g?n?ral, et le Mus?um de Rouen en particulier ont ?t? des acteurs dans la soci?t? locale sous la Troisi?me R?publique, et dans les d?bats scientifiques de cette ?poque. Pour concevoir comment et pourquoi un m?me lieu peut ?tre ? la fois un sanctuaire du patrimoine d?histoire naturelle, un site de recherche scientifique, un th??tre du d?bat des id?es scientifiques et un instrument politique, il faut retourner aux sources de ce qu?est l?histoire naturelle. ? travers l?histoire de l?histoire naturelle rouennaise, B?n?dicte Percheron nous montre brillamment ? quoi pouvait servir ce type d?institutions, et ? quoi elle sert encore. C?est pourquoi ce travail remarquablement ?rudit ne vaut pas ? mes yeux que parce que j?aime l?histoire naturelle, la Normandie et la ville de Rouen en particulier, mais bien parce qu?? travers cette analyse historique, c?est la f?condit? persistante de l?histoire naturelle, ses r?les scientifique, culturel et social permanents qui sont mis en ?vidence.
L?histoire naturelle : ce qu?elle est
L?histoire naturelle a ?t? - et est toujours - une m?thode d?enqu?te, d?inventaire, de description et de classification du monde naturel, ? tout ce qui est ?, humains compris. ? ses d?buts, il existait une histoire naturelle fixiste au si?cle de Linn? (XVIIIe si?cle). S?ajoutera progressivement ? ces aspects initiaux la prise en compte de l?histoire (au sens moderne du terme) des objets dans le temps long : c?est aujourd?hui la science de l?organisation de la diversit? du r?el, faite d?objets r?sultant d?une histoire particuli?re. L?histoire naturelle ?tudie les choses dans leur diversit?, leur temporalit? et leur historicit?. Elle s?int?resse aux lois, certes, mais surtout ? la singularit? des objets charg?s d?histoire et aux r?gularit?s que donne ? voir la moyenne des singularit?s. Elle s?int?resse au patrimoine naturel commun de l?humanit?, celle-ci incluse. Aujourd?hui, elle s?applique ? tous les niveaux d?organisation de la mati?re, de la min?ralogie et des donn?es g?n?tiques jusqu?aux ?cosyst?mes et aux plan?tes. Elle utilise pour cela les technologies les plus avanc?es et les plus innovantes.
Fait largement ignor? aujourd?hui, y compris par la majorit? des biologistes, l?histoire naturelle proc?de d?une m?thode particuli?re qu?on ne trouve pas ailleurs : l?histoire naturelle op?re par comparaison d?objets, laquelle commence avec trois objets. Objets est ici ? prendre au sens large : outils lithiques, sp?cimens de mus?es, individus biologiques, m?t?orites, cr?nes, artefacts humains, langues, symboles, s?quences d?ADN, etc. Cette comparaison se distingue d?autres comparai sons utilis?es ailleurs en science (par exemple la comparaison d?une situation exp?rimentale avec ses situations t?moins). Dans une situation exp?rimentale classique, les r?actions d?un syst?me d?interactions dans une situation contr?l?e sont compar?es aux r?actions d?un syst?me ?quivalent dans une autre situation et/ou ? un syst?me t?moin. De ces comparaisons d?couleront des d?ductions. Dans une approche par mod?lisation, les pr?dictions du mod?le sont compar?es aux donn?es issues du terrain. En recherche par immersion, l?observateur s?immerge au sein du ph?nom?ne ? expliquer et contribue m?me ? sa modification. Dans ce dernier cas, la comparaison n?est pas vraiment convoqu?e, sauf ? comparer un ?tat ant?rieur ? un ?tat post?rieur. En histoire naturelle, ce sont des objets contemporains qui sont compar?s. Compte tenu du fait que c?est l?histoire qui va rendre compte des diff?rences ou des ressemblances entre les objets, les causes de ces ressemblances ne s?inscrivent pas dans le temps de vie ou dans les processus qui rendent compte de la dynamique de l?objet lui-m?me, mais dans une trame historique d?objets semblables : il s?agit alors de pal?o-?tiologie, ou pal?o-?tiologie. En outre, les objets peuvent ?galement ?tre compar?s en diachronie, par exemple un organisme actuel et un fossile proche. Ce qui explique les objets ne sont donc pas les processus qui pourraient pr?sider ? leur changement individuel, mais une r?trodiction des conditions historiques qui leur ont donn? naissance.
Cette double caract?ristique de comparaison d?objets tourn?e vers un r?gime d?explication historien nourrit et entretient un lien original entre le terrain, le laboratoire de recherche et les collections d?objets et de sp?cimens. C?est pourquoi il existe des collections de r?f?rence dans les mus?es d?histoire naturelle. Chaque objet portant la trace d?une historicit? propre, chaque objet n?ayant exist? qu?une seule fois, il faut en r?f?rencer un certain nombre d?entre eux dans des collections de mani?re ? ce que les noms utilis?s pour d?signer des classes d?objets (par exemple des esp?ces) puissent s?ancrer dans le r?el gr?ce ? un r?f?rentiel porte-nom. Sans quoi, tr?s vite les usages langagiers divergent et on ne sait plus de quoi on parle. Ou bien les organismes ?voluent (organismes ? temps de g?n?ration court) ou disparaissent, et l?on ne sait plus de quoi parlait tel auteur d?il y a deux si?cles.
[...] -
Qu'est-ce que la science... pour vous ? Tome 2 ; 51 scientifiques, philosophes et amateurs de sciences répondent
Marc Silberstein, Collectif
- Editions Matériologiques
- 12 Juin 2018
- 9782373611663
«?Qu'est-ce que la science... pour vous???»
Telle est la question posée ici à des scientifiques, philosophes, historiens des sciences, médiateurs et amateurs de sciences.
Simple question certes, mais pas une question simple... Où est la vraie difficulté?? Définir la science ou accepter de se confier, loin du surplomb procuré par les piédestaux académiques?? C'est pourquoi la cinquantaine d'auteurs de ce tome 2 apportent des réponses variées, contrastées, éclectiques, que l'on peut décrire selon un gradient allant des textes les plus intimes et personnels à ceux qui observent scrupuleusement les codes de la prose universitaire. C'est qu'il n'est pas aisé de se dévoiler quand on aborde cette question essentielle, laquelle permet de délimiter un domaine majeur de la connaissance, aussi vaste et varié soit-il.
Les réponses sont souvent brèves - quelques pages - afin de condenser ce que les auteurs pensent parfois depuis des décennies. La concision demandée est presque à voir comme une contrainte oulipienne. Ainsi, les lecteurs peuvent lire une quintessence de points de vue, un instantané de pensée, la part sensible, parfois, des membres de cet informel aréopage.
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L'avenir de la complexité et du désordre
Jean-claude serge Levy, Salomon Ofman, Collectif
- Editions Matériologiques
- 17 Décembre 2018
- 9782373611830
Qu'est-ce que la complexité?? Et n'y en a-t-il qu'une sorte?? Ces rencontres pluridisciplinaires sur le thème complexité désordre vous invitent à un voyage entre art, philosophie, histoire, sciences dures et sciences humaines sous la conduite de spécialistes qui s'efforcent d'ouvrir leur message aux lecteurs?: non seulement leurs collègues directs, mais aussi et surtout les spécialistes d'autres disciplines, comme bien sûr les étudiants, les élèves et tout lecteur curieux. À travers la diversité des styles et des thèmes personnels, des questions majeures émergent, interconnectent les rapports et suggèrent de nouvelles applications. S'y révèle notamment la complexité de l'espace qui nous entoure, cet espace dans lequel la pesanteur déséquilibre l'isotropie et la régularité. S'y manifestent aussi le besoin et la nécessité d'observer la nature, sa complexité à différentes échelles, de différents points de vue, pour mieux l'appréhender dans sa globalité, dans sa diversité.
La complexité de la nature (physis) pose, depuis l'Antiquité au moins, les deux questions de savoir si et pourquoi elle nous est compréhensible. Les sciences naturelles et les mathématiques tentent de répondre principalement à la première question, la philosophie et les sciences humaines à la seconde. Chercher à aborder ces deux questions de concert nécessite donc une approche globale où se rejoignent des disciplines très différentes. C'est dans ce cadre que se situe cet ouvrage dont l'objectif, au travers de la diversité des analyses et des auteurs, est de fournir quelques éléments de réponse ou de réflexion sur la nature de la complexité.
Jean-Claude Serge Lévy est professeur émérite à l'Université Paris Diderot. Physicien du magnétisme, il s'est aussi intéressé à la structure des matériaux, aux réseaux de neurones, etc.
Salomon Ofman a une double formation de mathématicien et de philosophe. Chercheur au CNRS (Université Paris 7), membre du groupe Histoire des sciences mathématiques de l'Institut mathématique de Jussieu-Paris Rive gauche.
Contributeurs?: Kamel Boukheddaden, Nicolas Décamp, Philippe Depondt, Hung T. Diep, Kitsou Dubois, Pierre Ghewy, Laurent Goffart, Marc Jaillot, Victor Lefèvre, Vincent Legeay, Julien Léopoldès, Jean-Claude Serge Lévy, Fabrizio Li Vigni, Slawomir Mamica, Salomon Ofman, Hassan Peerhossaini, Raymond Pictet, Nicolas Piqué, Mouhamadou Sy, Anthony Tchekemian, Anne Tanguy, Gaston Tolila, Laurence Viennot, Thomas Vourc'h, Hervé Zwirn.
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Microbiodiversité ; un nouveau regard
Laurent Palka, Collectif
- Editions Matériologiques
- 10 Décembre 2018
- 9782373611632
Peut-on voir le vivant microscopique autrement qu'à travers le prisme de la lutte perpétuelle contre un monde principalement hostile qu'il faut vaincre pour assurer sa survie?? Telle est la question que la science soulève à la lumière des nouvelles connaissances.
Les recherches les plus récentes montrent en effet que les virus, bactéries, archées, protozoaires, micro-algues ou champignons sont essentiels pour comprendre comment s'est construit le vivant et prendre la mesure de sa complexité, comment il s'est propagé sur Terre, comment il fonctionne, de l'organisme à l'écosystème. Ces recherches révèlent également le potentiel que les micro-organismes représentent en termes d'utilisations bio-inspirées pour le futur de l'humanité et de la biosphère.
Cette partie de la biodiversité, si loin de nous mais si présente, est une solution et non un problème. C'est ce nouveau regard que le livre invite à porter sur ce qu'il convient d'appeler la microbiodiversité...
Ouvrage dirigé par Laurent Palka, enseignant-chercheur au Muséum national d'histoire naturelle, et préfacé par Bruno David, président du Muséum national d'histoire naturelle.
Avec les contributions de?: Sina Adl, Frédéric Barrière, Nathalie Becker, Lucie Bittner, Bernard Bodo, Alyssa Carré-Mlouka, Samuel Chaffron, Claire Cherbuy, Unai Escribano-Vazquez, Damien Eveillard, Thomas Flinois, Patrick Forterre, Morgan Gaïa, Muriel Gugger, Lionel Guidi, Philippe Langella, Enrique Lara, Jacques Livage, Josselin Lupette, Éric Maréchal, Lionel Ranjard, Bruno de Reviers, Marc-André Selosse, Muriel Thomas.